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图书馆坚持纸本文献和电子文献并重、实体馆藏与虚拟馆藏并重，形成了以中医药学为主、多学科协调发展的藏书体系。
馆藏纸本图书和期刊合订本超过440万册，电子图书及学位论文约1055万种
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馆藏纸本文献436.51余万册，中外文纸本期刊4134种
现有实体馆藏累计380余万册
馆藏纸本文献445万册
图书馆坚持纸本文献和电子文献并重、实体馆藏与虚拟馆藏并重，形成了以中医药学为主、多学科协调发展的藏书体系。