图书馆成立于1956年建校初期，作为学校的学习资源中心，是信息化建设的重要组成部分，是校园文化建设的重要基地，是人才培养的重要条件保障。近年来，学校加强图书馆建设，不断提升文献信息资源保障能力和为师生服务的能力。

目前，图书馆总建筑面积约3.4万平方米，共有阅览座位4680座；其中，袁家岗校区图书馆面积1.3万平米；缙云校区图书馆面积约2.1万平米。全校纸本图书221.7万册、电子图书499.8万册，以医学和生物科学为主，兼顾人文社会科学，文献资源数量和品种丰富，资源保障系统完善；建成了以临床医学资源为主的数字图书馆，订购有Nature、Elseiver、Springer、SCIE、Ebsco、Clinicalkey、Acland Anatomy、Cochrane Library、LWW Health Library、中国知网、万方、超星、牛津医学在线等80个国内外数据库；有馆藏书目数据库和领望随书光盘云系统。

图书馆提供阅览、外借、参考咨询、馆际互借、文献传递、情报检索、科技查新、用户培训等服务，阅览室周开放时间94小时。两校区图书馆图书借阅通借通还。图书馆拥有良好的网络基础设施和数字化环境，WIFI无线网络全覆盖，电子资源全天24小时开放，智慧图书馆平台实现实现一键式资源检索、个性化信息推送；建有数字互动体验空间，提供图书自助借还、OPAC查询、研习间预约等个性化服务。

我校于1960年成立档案资料室，1984年更名为综合档案科，2021年成立档案馆。档案馆建筑面积为1805平方米，有专业档案管理人员5人，建立了由各职能部门负责人、多名兼职档案员组成的档案工作人员网络，负责对全校各部门文件、图纸等各种档案材料的收集和立卷归档。

档案馆现有馆藏档案近10万卷，5000件，分为党群、行政、教学、财会、基建、出版、设备、外事、科研、声像十大门类，其中还包含职工医学院和重庆市中医学校合并至我校的文书、教学财会等档案。

目前我校档案馆藏资源数字化达90%（财务档案除外），可提供教学、科研，基建以及学籍网上查询等服务。